A presença carmelita em Santos data do final do século XVI, facilitada com a doação, pela família Adorno, da Capela Nossa Senhora da Graça, situada próxima ao Valongo, onde se passaram a exercer as atividades da Ordem. Construídas a partir de 1760, a capela e a igreja possuem um belo conjunto arquitetônico, constituído de duas igrejas entrepostas por uma torre de sinos revestida de azulejos portugueses.

Construída na região onde a cidade se estruturou, a antiga Igreja Matriz de Santos passou por várias reformas até ser demolida pelo poder público, em 1908, para dar lugar ao projeto de urbanização da Praça da República.

Localizada no Largo do Livramento, no final da rua Duque de Caxias, a Igreja de Nossa Senhora do Livramento dos Homens Pardos foi construída em 1851. No Largo ainda se mantêm conservados a maioria dos sobrados que o constituem.

Igreja localizada no Largo de São Francisco de Paula, nascido Largo ou Praça da Sé Nova no governo de Gomes Freire de Andrade. O culto a São Francisco de Paula foi introduzido no Brasil em 1754, pelo bispo Frei Antônio do Desterro. Ganhou tantos adeptos que nesse mesmo ano foi feito um pedido a Roma para que fosse fundada no Rio uma Irmandade da Ordem dos Mínimos, o que aconteceu em julho de 1756. Inicialmente a Irmandade ocupou uma capela no Morro da Conceição; em 1758 seus hábitos foram distribuídos e a imagem do padroeiro foi enviada para a Igreja da Santa Cruz dos Militares até que sua própria igreja fosse construída. Inicialmente era uma pequena ermida, mas com o crescente número de fiéis, em 1759 começaram as obras para uma ampla igreja, concluída somente em1865. Segundo Araújo Viana, a igreja figurou entre as mais belas e artisticamentes mais ricas do Brasil, em seu estilo jesuítico francês ou rococó. Mestre Valentim foi responsável por alguns dos trabalhos em talha e pelos adornos da capela principal.